Teşvik modülü işletmenin karmaşık mevzuat nedeniyle kullanamadıkları prim teşviklerinden yararlanmalarını sağlamaktadır. Teşvik modülünde çalışanların prim teşvikleri işletmenin en çok avantajı sağlayacağı şekilde otomatik olarak hesaplanarak bordro ve muhtasar beyannameye otomatik olarak gönderilmektedir. Teşvik modülü yeni bir teşvik kanunu yürürlüğe girmesi veya mevcut bir teşvikinde kaldırılması ya da değiştirilmesi durumunda değişen mevzuata uygun olarak güncellenmektedir. EYA HR kullanan işverenler teşvik hesaplama yapmalarına gerek olmadan teşvik modülü her dönem düzenli olarak çalışanların yararlanacağı teşviklerin operasyonel işlemlerini kendi içerisinde otomatik olarak yapmaktadır. Teşvik modülünde kullanıcı dostu bir raporlama ve istatistik sistemi kurulmuştur.